Если исходный код не должен быть скопирован и вставлен из презентации, быстрое и грязное решение могло быть, чтобы просто сделать снимки экрана исходного кода.
Вставка от Eclipse должна сохранить форматирование если поддержки приложений это. Я знаю, что Word делает... не уверенный в PPT.