Как скопировать файл в другой каталог с помощью ssh?

Если Вы подключены к сессии оболочки через ssh, и файл существует в удаленной системе, можно использовать команду CP.

cp sourcefile destfile

Если файл существует в локальной системе, необходимо использовать sftp. Если Ваша локальная машина запускает Windows, WinSCP является превосходным sftp клиентом.

Принятие Вы используете командную строку затем как это

scp myfile.txt dest/

для локального файла или альтернативно

scp user@myserver:/path/to/myfile.txt user@myserver:/path/to/dest/

При использовании Win32 Tunnellier является разумным решением, которое не только позволяет передачу файлов, но и безопасный удаленный доступ также.