Ну, Redhat (RHEL) был бы "естественным" выбором (поскольку JBoss является подразделением Redhat). CentOS является другой опцией. Но, честно говоря, JBoss работал бы приятно на Сервере Ubuntu также (что Вы могли бы хотеть выбрать, если Вам нравятся базирующиеся дистрибутивы debian).
Это - такой личный выбор и нет никаких соответствий ответа всех.
Лично, я нахожу выпуск сервера Ubuntu самым легким для продолжения, как это прибывает в один CD и легкий добраться.
Мне нравится CentOS за серверы. Поскольку это основывалось на RedHat Enterprise, пакеты, которые они включают и выбор, который они делают, все нацелены на рынок сервера предприятия (в противоположность рабочим столам как некоторые другие дистрибутивы).