Где делает хранилище Mail.app OS X почтовый ящик Мусора на жестком диске?

Это зависит. Открытые предпочтения-> Учетные записи-> поведения Почтового ящика.

Проверьте настройки Trash.

Если "Перемещение удалило сообщения к trashmailbox". Затем Ваши удаленные сообщения будут перемещены в почтовый ящик мусора, в противном случае затем у Вас ничего никогда не могло бы быть в trashmailbox...

если "Хранят удаленные сообщения на сервере", проверяется, то почтовый ящик, в который помещается мусор, НЕ находится на Вашем компьютере...

Таким образом, у Вас не может быть локального хранилища мусора...

Не волнуйтесь к очень.

Посмотрите в папке имени/почты Пользователя/компьютера резервного копирования

из одной из машины времени создают резервную копию файлов