Я использую videolan. Это - списки списка функций MOV как формат ввода.
VLC стоит попытки.
Apple мешала третьим лицам делать что-либо интересное с.MOV файлами. Их опубликованная документация является чрезвычайно устаревшей, новые кодеки фактически не документированы, и у них есть лицензионное соглашение, что basicly говорит, что Вы даже не попробуете.