Можно хотеть попробовать BeyondCompare. Я не знаю, подходит ли это для файлов ПО, но это может также быть "обучено" таким файлам. Я знаю, что строки часто разделяются на несколько строк, которые могут вызвать некоторые проблемы. Иначе, поскольку файлы ПО являются файлами простого текста (в UTF-8 обычно), это должно быть легко.
Можно также хотеть записать некоторый сценарий жемчуга для этого. Я помню, что записал что-то, чтобы взять файл ПО и представить печатаемый документ со строками, к которым присоединяются.
Программное обеспечение Beyond Compare доступно здесь: http://www.scootersoftware.com/moreinfo.php
Я понимаю, что плагины могут быть записаны для Вне всякого сравнения.
Имейте великий день :-)