Как объединить два набора файлов

У меня есть несколько очень неорганизованных резервных копий корневых каталогов (тот же пользователь), что я горел в течение лет. Время от времени я просто скопировал весь корневой каталог в новый каталог на огромном жестком диске. Формат корневого каталога изменился очень в течение лет, и некоторые большие, важные файлы были просто удалены для оставления свободного места (я знал, что было резервное копирование). Еще хуже некоторые файлы были перемещены от чего-то как myfile кому: old/myfile.

Теперь, я хочу объединить эти резервные копии в один всесторонний каталог, который имеет одну и только одну копию всего (только последняя копия). Я хотел бы инструменты, которые используют материал как имя файла, измененная дата и SHA1Checksums для объединения этих файлов. Каковы некоторые хорошие инструменты, которые могут сделать это?

Никакой совет относительно того, как я должен был использовать программное обеспечение для резервного копирования. Однако я не возражал бы слышать некоторые программные функции, что справка преобразовывает эту текущую грязную модель в централизованную резервную модель.

Спасибо