Internet Explorer 8 не загружает страницы, открытые в новом Windows, но делает в том же окне и вкладках.
Windows 7, переустановленный Internet Explorer 8, и обновленный.
Мысли?
Дополнительно, если Вы хотите, чтобы другая программа открылась, новое окно (скажите щелчок на ссылку из перспективы), можно проверить "Новое окно" в соответствии с "Открытыми ссылками из других программ в":