Если я понимаю Вас правильно Вы wnat для удаления всех резервных копий единственного файла, но не целого резервного копирования (все резервные копии всех файлов). корректный?
Просто включите Машину времени, щелкните правой кнопкой по файлу, который Вы хотите стереть из своего резервного копирования и выбора Delete all backups of <filename>
При навигации по Машине времени перейдите к существующему представлению и нажмите небольшой значок механизма на панели инструментов Средства поиска, в то время как у Вас есть файл, Вы хотите удалить выбранный. Просто нажмите опцию Удалить все резервные копии Машины времени этого файла, и файл закончится навсегда.