От rsync(1)
страница справочника:
--ignore-existing skip updating files that exist on receiver
--ignore-times
опция должна сделать это.
От man rsync
:
- Я, - игнорировать-времена
Обычно rsync пропустит любые файлы, которые уже являются тем же размером и имеют ту же метку времени модификации. Эта опция выключает это поведение “быстрой проверки”, заставляя все файлы быть обновленной.