Вероятно, корректный ответ - то, что Chrome не имеет этой функции. Лучшим путем я нашел до сих пор для очистки всех cookie, но cookie с некоторых определенных веб-сайтов используют CCleaner. Можно выбрать в опциях, какие cookie веб-сайтов Вы хотите сохранить, и выполнить CCleaner время от времени.