Вы означаете запускать Приложения Windows? Существует Crossover Linux, Crossover Games, & Cedega - но всем платят и используют ВИННУЮ кодовую базу. Другой Моно, который реализует платформы .NET и время выполнения на Linux.
Хотя не "как Вино", Виртуальные машины являются отличным способом под управлением Приложений Windows на Linux. Существует несколько механизмов виртуальной машины в свободном доступе для Linux, таких как VirtualBox, но для выполнения Приложений Windows, Вам все еще будет нужна копия Windows.