Поток альтернативы NTFS в сжатом архиве?

RAR является единственным, который делает прямо сейчас, AFAIK.

Из командной строки Вы использовали бы - переключатель OS

-os     Save NTFS streams. Windows version only.

        This switch has meaning only for NTFS file system and allows
        to save alternative data streams associated with a file.
        It is especially important in Windows 2000, XP and newer,
        which use streams to keep some file dependent information
        like file descriptions. If you use RAR to backup your
        NTFS disks, it is recommended to specify this switch.

Я не уверен, как способность появляется в GUI WinRAR, если вообще.

Это находится в GUI, когда Вы идете для создания архива под вкладкой "Advanced", в "кадре" опций NTFS, наряду с флажком для сохранения информации полномочий NTFS.