Windows 7/Windows 7 две двойных загрузки HDD - chkdsk бежит за перезагрузкой/завершением работы

У меня есть машина, которая шла с Windows 7 64bit на одном жестком диске (ssd). Я установил Windows 7 с помощью аварийных дисков OEM на втором диске (ssd), и я - в настоящее время двойная загрузка с помощью меню начальной загрузки BIOS. И в Windows 7 устанавливает все жесткие диски, смонтированы и видимы друг другу, так, чтобы я мог совместно использовать файлы между ними.

Проблема, которую я испытываю, состоит в том, что несколько раз уже (в короткий промежуток времени) chkdsk работает, когда я переключаюсь между ОС, говоря, что существуют проблемы, которые должны восстановить, который это делает и затем это загружается прекрасный. Однако в прошлый раз, когда я загрузился в Windows A, он сказал, что существует проблема с разделом A, и он не может выполнить chkdsk. Я загрузился в Windows B, который выполнил chkdisk автоматически и зафиксировал раздел A, но A не загрузится из-за "синего" экрана. Я закончил тем, что использовал некоторый инструмент восстановления OEM, который обнаружился в меню начальной загрузки Windows A, и это зафиксировало его.

Мой вопрос:

Моя установка неправильно? Почему я вижу те chkdsk проблемы? Один из моих друзей предположил, что Windows B перезаписывает идентификатор объема Windows A, который заставляет его запутываться и виза-versa, но я ничто не могу найти полезным в Интернете?

P.S.: Я имею, выполнил многочисленные инструменты диагностики жесткого диска на обоих жестких дисках, и они не показывают проблем.