Как я могу сделать ls (или какая-либо другая команда) перечисляют только файлы, больше, чем определенный размер файла?
Используйте находят и -size флаг.
-size
Найти файлы больше, чем 100 МБ:
find . -type f -size +100M
Если Вы хотите текущий dir только:
find . -maxdepth 1 -type f -size +100M