Под Опциями-> Опции Панели выбирают выделение Файла-> Типы файлов.
Посмотрите man mc
в разделе Colors для способов выбрать конкретные цвета путем включения записей Ваш ~/.config/mc/ini
файл. К сожалению, кажется, нет ключевого слова для скрытых файлов.