Специальная команда упорядочивает доступный, описаны в "Используя PuTTY" страница документации.
Однако для проверки туннелей Вы имеете открытый, Вы щелкнули бы правой кнопкой по значку PuTTY в верхнем левом углу окна и выбрали бы "Change Settings", затем выполнили бы развертку к Соединению → SSH → Туннели. Отсюда Вы и представление и изменяете туннели, которые Вы используете.