Что ОС / Платформа являетесь Вы использованием? У меня были некоторые проблемы с видео Handbraked, когда у меня был старый Плагин EyeTV, установленный на сменной папке Quicktime... Это могло бы также относиться к старым плагинам DIVX также, так как EyeTV связывает версию Divx.