Я только хочу, чтобы это вернулось к "правилам" использования частоты
Используя "Remove from this list" пункт меню не изменяет используемые правила. Все, что Вы сделали, обнулить счетчики использования Вашего приложения; это должно вновь появиться в нескольких запусках.
Если это не делает, попробуйте:
reg delete HKCU\Software\Classes\Applications\cmd.exe /f
reg delete HKLM\Software\Classes\Applications\cmd.exe /f
reg delete HKCU\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\UserAssist\{75048700-EF1F-11D0-9888-006097DEACF9}\Count /f /v "HRZR_EHACVQY:%pfvqy2%\Npprffbevrf\Pbzznaq Cebzcg.yax"
reg delete HKCU\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\UserAssist\{75048700-EF1F-11D0-9888-006097DEACF9}\Count /f /v "HRZR_EHACNGU:P:\JVAQBJF\flfgrz32\pzq.rkr"
taskkill /im explorer.exe /f && explorer.exe
... или очистите список программ и снова наполните его наиболее используемыми программами.
... или просто прикрепите его там.
Если Вы действительно хотите запретить объекту Меню "Пуск" появление в Часто Используемом списке Программ, используйте панель задач TweakUI и Меню "Пуск" → Меню "Пуск", и (ООН) отмечают программу.