Проблемы безопасности с виртуальным сервером в противоположность выделенному серверу?

Единственные проблемы, которые Вы будете иметь, являются проблемой общей производительности. Принятие Вас относится к VPS или виртуализированному серверу, каждый виртуальный сервер полностью отгорожен перегородкой с сервера "хоста", который управляет каждой из виртуальных машин. Безопасность на виртуализированном сервере несколько не отличалась бы, чем это будет от выполнения выделенного сервера.