Как я заставляю .bat файлы работать вместо того, чтобы быть открытым с Блокнотом?

Если Вы переходите к Проводнику, и переходите к Инструментам, Опциям, и нажимаете вкладку File Types, можно прокрутить вниз и видеть.BAT. Свяжите его с cmd.exe.