Используя различные xstartup файлы с VNCServer на Ubuntu

Вы не можете непосредственно выполнить другой xstartup файл, но так как это - действительно просто сценарий оболочки, можно выполнить это путем создания логики сценария, которая может выяснить, является ли это первой или второй сессией VNC.

Например:

#!/bin/sh

# switch on display number for special sessions
[ $DISPLAY == ":1" ] && exec startupOne
[ $DISPLAY == ":2" ] && exec startupTwo

# ... else use the normal vnc xstartup

# Uncomment the following two lines for normal desktop:
# unset SESSION_MANAGER
# exec /etc/X11/xinit/xinitrc

[ -x /etc/vnc/xstartup ] && exec /etc/vnc/xstartup
[ -r $HOME/.Xresources ] && xrdb $HOME/.Xresources
xsetroot -solid grey
vncconfig -iconic &
xterm -geometry 80x24+10+10 -ls -title "$VNCDESKTOP Desktop" &
twm &