Это кажется использованием Хрома xdg-open открыть файлы PDF.
xdg-open
Как я изменяю его на другого читателя PDF?
Я использую Linux Mint 8 LXDE.
Проверьте их: /usr/share/applications/defaults.list ~/.local/share/applications/defaults.list
/usr/share/applications/defaults.list
~/.local/share/applications/defaults.list
И команда xdg-mime. Использовать man xdg-mime к прочитайте руководство :))).
xdg-mime
man xdg-mime